Certifikatordningen for bionaturgas gør det muligt at spore bionaturgassen gennem forsyningskæden. Køberne får på den måde dokumentation for oprindelsen af den gas, de køber. Hver enhed bionaturgas, som bliver tilført naturgasnettet, erstatter en tilsvarende enhed konventionel naturgas. 
Selve bionaturgassen kan derfor godt forblive fysisk i distributionssystemet i fx Vestjylland samtidig med at en forbruger i København ved et antal certifikater får garanti for, at en bestemt mængde gas, som aftages i København, er produceret på basis af biogas.
Ordningen sporer de aftalemæssige og ikke de fysiske strømme. Certifikatet hænger altså ikke sammen med salget af selve gassen, men kan sælges og købes uafhængigt. Biogasproducenten kan vælge at sælge certifikaterne til en anden certifikatkonto-indehaver, til en slutbruger eller annullere dem.
Certifikaterne gør det mulige at spore hver enhed på 1 MWh bionaturgas fra den bliver tilført distributionsnettet, gennem alle handler og til det bliver solgt til forbrugerne. Ordningen er yderligere beskrevet i modelpapiret for certifikatordningen.
Registrering af certifikatkontoindehaver og biogasanlæg
Hvis du er ejer af et biogasanlæg, der tilfører bionaturgas til naturgasnettet kan du få udstedt certifikater på biogassen. Andre virksomheder, som ønsker at overdrage gascertifkater kan også tilmeldes vores certifikatregister.
Uanset om du er ejer af et biogasanlæg eller anden virksomhed skal du oprette en certifikatkonto hos Energinet.dk. Det gør du ved at udfylde en registreringsformular, og indsende som bilag i en e-mail:
Den udfyldte formular sendes til: gascertifikat@energinet.dk
Alle kontoindehavere og produktionsanlæg er opført i denne liste.
Fordelen ved gascertifikatordningen
Hver MWh bionaturgas bliver elektronisk øremærket med et unikt identifikationsnummer på et gascertifikat. Hvert certifikat indeholder desuden information om hvor, hvornår og hvordan bionaturgassen oprindeligt er produceret.
Når forbrugere køber certifikater er det deres garanti for, at den certificerede mængde gas er produceret på bæredygtig vis og ikke er blevet solgt til andre. Ordningen er en simpel og troværdig måde at eliminere dobbelttælling af den registrerede bionaturgas.